本发明涉及一种流感病毒血凝素RNA干扰序列及其应用。本发明提供了一种流感病毒血凝素RNA干扰序列，以及能表达该序列的载体。本发明RNA干扰序列及其表达载体能够有效抑制动物体内流感病毒的复制，并且在实验期内没有明显的副作用，为流感病毒的防治提供了一种新的有效选择，在制备抗流感药物中有很好的应用前景。