一种天然脂肪酸盐和多聚赖氨酸水凝胶及其制备方法，属于功能因子载体制备技术，其中，该水凝胶为天然脂肪酸盐和多聚赖氨酸的水凝胶，通过如下步骤制备：溶解→混合→静置。本发明所采用的原料成本较低，又是天然营养物质，且加工工艺简单易操作；本发明的水凝胶具有天然、安全、可生物降解的特点，因此可以将其开发成药物或者天然活性物质的载体，应用于食品、医药、化妆品领域，前景广阔。