本发明提供了一种谷糠抗肿瘤活性蛋白及其制备方法，以及该蛋白在制备抗肿瘤药物和保健食品中的应用。其制备方法是将纯天然谷糠粉碎，加入蛋白提取液低温过夜提取，随后加入预冷的丙酮低温沉淀蛋白，得到谷糠粗蛋白。在粗蛋白提取液中加入不同饱和度的硫酸铵粉末，分级沉淀蛋白，将硫酸铵沉淀的蛋白过Q阴离子交换层析柱，收集穿透液，再将其过SP阳离子交换层析柱，用0.1mol/L Tris-NaCl洗脱液洗脱，收集洗脱峰得到谷糠抗肿瘤活性纯蛋白(FMB)。该蛋白可明显抑制大肠癌细胞增殖和转移，可以在制备抗肿瘤药物和保健食品中应用。