本发明涉及一种嵌段共聚物mPEG-PLGA/无定形硅酸钙水合物复合纳米材料及其制备方法和应用，所述复合纳米材料具有球形或类球形的实心、核壳或多囊泡结构，所述复合纳米颗粒的尺寸为10～100nm，所述复合纳米材料的化学组成中钙与硅的摩尔比为0.3：1～0.7：1。本发明以生物相容性好、可降解的嵌段共聚物作为有机模板剂用于硅酸钙水合物复合材料的制备，可以有效地保持无定形硅酸钙，且嵌段共聚物的疏水性使得复合材料可作为对疏水性药物和蛋白质的储存库，进而可用作药物输送和蛋白吸附，在生物医药领域具有良好的应用前景。