本发明涉及两个肽聚糖结合蛋白及其编码基因BjApextrin1和BjApextrin2，以及该蛋白在制备治疗感染性疾病药物中的应用。本发明根据已有的EST序列通过5′RACE和3′RACE,从中国文昌鱼的消化道中分离得到文昌鱼BjApextrin1和BjApextrin2基因,其DNA序列如序列表中序列1和序列2所示。该基因编码的蛋白（BjApextrin1和BjApextrin2），其氨基酸序列如序列表中序列3和序列4所示。本发明的基因BjApextrin1和BjApextrin2编码的蛋白能够识别和凝集革兰氏阳性菌，并且特异结合细菌表面的生物大分子肽聚糖，可用于作为制备治疗感染性疾病的药物。