本发明涉及一种脱氮副球菌的培养方法及其在养殖水质净化中的应用，属于水产养殖技术领域。其采用对水产养殖生物和脱氮副球菌无害的糖蜜、味精废液等多种低价值材料和生产废弃物为原料，经合理复配成液体培养基并生产高活性高浓度的脱氮副球菌菌液，将菌液直接投入养殖水体，修复养殖水体生态环境，为水产养殖生物营造一个有利于生存和生长的良好水体环境。本发明使用后见效快且效果稳定，可根据水体溶氧情况选择所需去除的无机氮素形式和去除速率，显著降低水体中氨氮、亚硝酸盐、硝酸盐等有害物质的含量，改善水环境质量和养殖生物生存条件，提高养殖生物的产量和质量。