本发明涉及一种通过选择性培养围塘微藻群落提高滩涂贝类养殖产量的方法，具体针对围塘泥蚶和毛蚶的养殖，通过调节水体营养盐组成，选择性培养围塘内微藻群落颜色呈现棕黄色；针对青蛤和缢蛏，通过调节水体营养盐组成，选择性培养围塘内微藻群落颜色呈现黄绿色。根据本发明提供的方法，相应滩涂贝类生长速度明显比传统养殖的滩涂贝类生长速度要快，可大幅提高单位面积围塘内相应养殖滩涂贝类的产量。