本发明公开一种棉杆制本色浆的方法。该方法包括如下步骤：（1）蒸煮：在115～125℃下，用生物催解剂、表面活性剂和渗透剂对棉杆原料处理20～30min，以相对于棉杆原料的绝干重量计，生物催解剂的用量为0.1～0.5%，表面活性剂的用量为0.1～0.3%，渗透剂的用量为0.1～0.2%；（2）磨浆：蒸煮所得的物料进入磨浆机，磨浆得到本色浆。与传统的化学法制浆相比，本发明吨纸用水量大大降低，粗浆得率可达75～80%，同时实现污水零排放。本色浆再经高浓磨浆和低浓磨浆后抄制的高强瓦楞纸与传统的亚铵法所得浆抄制的瓦楞纸相比，能提高80%的环压指数。