一种难降解制药园区尾水的处理工艺，属于制药园区尾水以及其它工业废水处理领域，特别涉及污水深度处理全流程、二级污水处理厂的升级改造。本发明针对难降解工业园区尾水可生化性差的问题，首先对其进行活性污泥吸附-臭氧氧化的预处理，使用1000mg/L的活性污泥在吸附时间为15min的条件下将尾水中难降级有机物进行去除，在臭氧投加量为20mg/L、氧化时间为30min条件下提高水质的可生化性。预处理后的尾水与经过沉砂、初沉后的生活污水进行混合，进入二级生化处理单元。经过改良A²/O的预缺氧-厌氧-缺氧-好氧的有机物去除和脱氮除磷处理，出水达到国家一级A排放标准。