一种医用海藻酸钠凝胶微球及其制备方法和应用，该医用海藻酸钠凝胶微球包括复合药物载体和水不溶性药物，所述复合药物载体包覆所述药物，所述复合药物载体为离子交联剂-海藻酸钠-二价金属离子，其中的离子交联剂为4-氨甲基苯甲酸或对氨甲基环己烷甲酸。其制备方法为：(1)将离子交联剂水溶液与二价金属阳离子盐溶液等体积混合，得到复合凝固液；(2)将药粉或药剂分散到海藻酸钠水溶液中，混合均匀后，通过高压静电液滴发生装置或注射器针头，滴入步骤(1)的复合凝固液中，固化成球；(3)用蒸馏水洗涤得到的凝胶微球，脱水，常温干燥。该医用海藻酸钠凝胶微球可用于治疗结核、内分泌疾病和肿瘤，还可用于治疗局部急性出血和慢性渗血。