一种程控热熔机及其热熔方法，该程控热熔机包括机架；装设在该机架底部的底座，该底座固定待热熔件；装设在该机架上部的刀具架，装设刀具对该待热熔件进行热熔作业；控制该底座的平移与旋转的第一驱动装置；控制该刀具架的移动与旋转的第二驱动装置；及一控制器，该控制器设有通讯接口用以输入程序，该程序控制该第一驱动装置及该第二驱动装置的动作及行程。利用该底座可完成对不同批次、不同形状的待热熔件的热熔作业，如此便节省重复制作底座的设备成本，也无需花费额外人力资源以对不同底座进行安装及拆卸动作。