本发明涉及一种基于Android的透明数据存储的方法和系统，属于移动计算领域。本方法包括，读取系统的配置信息，利用用户文件系统接口模块提供一组可以重新实现文件操作语义的用户态的接口，通过用户态的程序实现这组用户态的文件操作接口。根据手机设备的网络连接情况，提供本地模式和网络模式下的基本的文件操作功能。本地模式下把文件操作重新定向到本地的另一个目录下；网络模式下利用ftp作为通讯协议，把文件操作重定向到服务器端。网络模式下为了提高效率增加了本地缓存，同时还要保证手机端和服务器端的数据一致性。