本发明公开了一种地表水水质自动监测集成系统，包括：管理模块和多个地表水水质自动监测站，该管理模块包括配置管理模块和系统管理模块，其中配置管理模块用于对系统字典表数据进行管理，该系统字典表数据包括个性化配置数据、通讯协议设置数据、仪器管理数据和打印模板设置数据，所述的系统管理模块对多个地表水水质自动监测站的信息资料进行录入，实现站点管理和用户权限管理，所述的地表水水质自动监测站包括实时监控模块、报警管理模块、数据管理模块、统计查询模块、综合分析模块、报表管理模块、远程控制模块、运营管理模块和质控管理模块。