本发明公开了一种基于三维打印的多功能复合药片制备方法，包括：（1）收集对同一疾病具有协同治疗作用的一个或多个药物，记载每个药物的相关信息；（2）根据得到的药物的信息，确定复合药片的结构，利用三维软件得到三维打印机的加工代码；（3）针对每一种药物，确定水凝胶体系，分别配置该药物的水凝胶溶液；（4）将水凝胶溶液分别注入三维打印机的对应的喷头内，进行三维打印，打印完成后，形状固定，得到多功能复合药片。本发明还公开了一种上述方法制备得到的药片。本发明的药片基于三维打印机制造，生产效率高，操作简单方便，能生产不同形状，不同结构，不同载药量和多种药物组合的药片，柔性化程度高，满足个性化定制。