一种屠宰生产线识别及控制系统及其识别方法，该系统包括一数据服务器以及与数据服务器通讯连接的若干个控制器；与各控制器或数据服务器通讯连接的射频读写器；至少一轨道射频电子标签，该轨道射频电子标签与屠宰物一体设置，并在生产线上移动标识所述屠宰物；所述生产线还设置至少一检测模块，通过检测模块的控制器及读写器，将检测数据写入到对应屠宰物的所述轨道射频电子标签内；以及一分离控制模块，由其读写器读取轨道射频电子标签，并根据检测数据，由其控制器控制一岔道分离装置，分离不同类别的被屠宰物。本发明实现了屠宰加工中对被屠宰物自动标识、自动识别、自动跟踪、自动控制和管理，同时也极大地提高了生产效率。