一种深海底孔隙水压力长期观测自动布放系统与方法，包括自动升降孔压计、水声/长波通讯器、船载控制器和布放设备，自动升降孔压计自下向上依次包括下钻头、配重、主控舱、浮体材料、上钻头和保护架；水声/长波通讯器与船载控制器用于对自动升降孔压计进行控制。布放时通过吊钩将布放支架和自动升降孔压计送入海床表面；下钻头开始钻孔进入沉积物，到达设定深度后停止运行；通过缆绳收起吊钩布放完成。回收时，通过发射控制信号启动释放器，使自动升降孔压计除下钻头及其配重以外的部分分离，使其上浮，并进行回收。本发明避免了复杂深海仪器的反复布放回收，提高了工作效率，降低了科研成本，避免了回收再布放过程对现场研究环境的人为扰动。