本发明提供了一种终端设备与移动终端之间传输数据的方法及系统，该方法包括步骤：a：终端设备与移动终端之间通过通讯端口和控制端口连接；b：当需变更传输数据类型时，终端设备通过控制端口向移动终端发送指令；c：移动终端收到指令后，变更通讯端口的数据解析程序，并在完成变更后应答终端设备发来的指令；d：终端设备收到移动终端的应答后通过通讯端口传输新的数据类型。本发明终端设备和移动终端之间只需要使用两个端口，就能实现多个类型数据在通讯端口上的分时传输，并且各类数据不会相互干扰。使用本技术能节省了硬件成本、降低实现难度，进而节约开发时间和开发成本，提高移动终端产品的竞争力。