本发明涉及一种整车网络配置系统及其配置方法，包括生产线的下线检测设备EOL，网关，整车CAN网络以及整车中一个或多个电控单元ECU；其中，所述下线检测设备EOL用于获取整车网络配置信息，其与所述网关之间通讯连接，并可将所述整车网络配置信息写入网关，所述通讯连接为基于诊断通讯的诊断通讯连接；所述网关用于从整车网络配置信息中提取CAN配置信息，其与所述整车CAN网络通讯连接，并可将CAN配置信息发布到CAN网络上；所述电控单元ECU用于从所述整车CAN网络获取配置信息。