一种采用双通讯路径认证的手机支付系统和相应方法，包括支付中心(1)、商户收款终端(2)、用户手机(3)，支付中心(1)通过两条不同通讯路径来认证用户的身份和支付操作，认证成功后才进行支付操作，其中，支付中心(1)通过通讯网络(7)接收商户收款终端(2)发出的交易信息来认证支付操作，和支付中心(1)通过电话网络(6)接收用户手机(3)致电呼叫商户收款电话号码的来电呼叫来认证用户身份；认证支付操作及用户身份成功后，小金额支付就从用户的小金额支付帐户转帐支付金额的钱到该商户在收单银行(4)的帐户；大金额支付就从用户在发卡银行(5)的银行卡帐户转帐支付金额的钱到该商户在收单银行(4)的帐户。