本发明公开了一种藻类浓度原位荧光检测装置。本发明以多波段LED激发光源，以雪崩二极管为探测器，研发了一种用于藻类浓度测量的原位荧光检测技术与装置，该装置解决了光学测量窗口污染、自然光照和浊度对荧光测量结果的影响等问题，可满足野外自然光照条件下水体藻类浓度原位快速监测需求。该装置可用于野外水体藻类浓度快速调查，也可以固定安装于浮标上或者自动监测站中对固定监测点的藻类浓度进行长期连续监测，具有良好的市场前景。