本发明公开了红外对管触摸屏系统及其通讯方法，该系统包括多个板卡，每个板卡连接一个单片机，单片机根据是否与计算机相连，设置为主控模式和受控模式；板卡包括电阻阵列，识别板卡的灯管数量，并向所连接的单片机输出表示灯管数量的输入信号；主控模式的单片机向受控模式的单片机发送指令，该指令包括设置单片机编号的信息和获取灯管数量的指令；受控模式的单片机根据该指令记录自身编号，并将自身编号和表示灯管数量的输入信号发送给所述主控模式的单片机。本发明的板卡包括电阻阵列的多个并联支路，每条支路包括两个电阻，其中一个电阻的一端与电源连接，另一个电阻的一端与地连接，两个电阻的另一端择一的与信号输入端连接。本发明的系统能够自动识别触摸屏中的红外对管数量，在触摸屏的尺寸改变时不需要修改单片机中的软件，并且各板卡具有通用性。