本发明公开了一种处理烟草废弃物或有机氟废水的方法，处理烟草废弃物的方法包括：将烟草废弃物加入水中混匀，得到混合液，向混合液中加入活性污泥、节杆菌TW种子液和信号分子制剂，曝气处理18-48h；处理有机氟废水的方法包括：向有机氟废水中加入活性污泥、节杆菌TW种子液和信号分子制剂，曝气处理24-72h；其中，节杆菌TW的保藏号为CGMCC No.7.47；信号分子制剂由N-3氧代-己酰基-高丝氨酸内酯溶液和N-己酰基-高丝氨酸内酯溶液混合而成。本发明方法投加次数少，经济环保，持久性好，能优先、快速、高效地降解烟草废弃物中的尼古丁或有机氟废水中的4-氟苯胺，减少其危害，对环境保护具有较大意义。