本发明涉及用于幼体和成熟柑橘遗传转化的方法和组合物。在一些实施方案中，本发明提供用于柑橘遗传转化的利用根瘤菌-介导的DNA投递的方法和组合物，以及通过任何DNA转移法，包括中华根瘤菌而提高成熟柑橘遗传转化频率的方法。从柑橘幼苗或或成熟柑橘植物的新形成芽(例如，来自嫁接在根茎上后成熟植物芽的新生芽或成熟植物的非常嫩的芽)的上胚轴制备的结间茎节通过在人工培养基诱导愈伤组织形成而预处理。基本上或完全除去在直接相邻的组织中的所有愈伤组织和任何发育分生组织区域，并且所述预处理的外植体随后通过中华根瘤菌或其他已知的方法转化。完整植物或嫁接于根茎上的芽随后从所述转化的细胞再生。