本发明公开了一株耐硝酸盐的硫酸盐还原菌，其分类命名为梭菌（Clostridium sp.）taihuN5，该菌株保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏日期为2012年11月23日，保藏编号为CGMCC No.6887。本发明还公开了上述耐硝酸盐的硫酸盐还原菌在重金属废水处理中的应用。本发明提供的耐硝酸盐的硫酸盐还原菌在高浓度硝酸盐条件下能保持正常的生长代谢，进行硫酸盐还原，为良好的复合硫酸盐还原菌处理重金属废水工艺的菌种来源。