本发明公开了一株雷氏普罗威登斯菌及其应用，该菌命名为雷氏普罗威登斯菌（Providencia rettgeri）YL，于2013年4月28日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心（CGMCC），保藏编号为CGMCC No.7544。上述雷氏普罗威登斯菌用于含氮有机废水的处理，可有效去除水体中的有机氮、氨氮、亚硝氮及硝氮，并同时实现对有机碳的去除，整个有机碳及氮素同步去除过程仅需一个好氧阶段即可实现。该菌株具有异养硝化-好氧反硝化的功能，只需在好氧条件下可实现有机碳和氮素的同步去除，能大大减少占地面积和建设资金，能缩短系统启动的时间，减少处理成本，提高处理效率。