本发明公开了一种农村生活污水的多级厌氧-好氧组合脱氮除磷装置及方法，本发明的装置包括进水口、N个厌氧池、N个好氧池、曝气装置、出水口和气体循环泵等，设置多级厌氧-好氧交替组合处理单元，各处理单元高程按水流方向依次降低，节约能量；本发明的方法步骤为：1）将待处理污水引入一级厌氧池，利用一级厌氧池内甲烷进行反硝化脱氮；2）经过步骤1）处理的污水以自流方式进入一级好氧池，在一级好氧池内好氧处理；3）经过步骤2）处理的污水依次进入后续处理池，重复步骤1）和2）的处理过程，最后从出水口排出。本发明能高效去除污水中的氮磷物质，充分利用农村现有条件，避免甲烷二次污染，体现了绿色环保的理念，适于推广使用。