本发明公开了一种硝化微生物燃料电池。它由阳极室、阴极室和质子交换膜组成；阳极室设有立方形反应器和密封盖，立方形反应器下部设有进水管，上部设有出水管，中部设有曝气区、反应区和隔离板，曝气区和反应区由隔离板分开，上下连通并充注产电基质；产电基质中放置硝化菌挂膜阳极，反应区顶部密封盖上设有阳极导线固定管；曝气区底部设有布气管；阴极室设有立方形反应器和密封盖，立方形反应器下部设有进水管，上部设有出水管，立方形反应器浸有阴极液，阴极液中放置阴极，顶部密封盖上设有阴极导线固定管。本发明以无机物氨为原料，结构简单，操作条件温和，内阻小，产电效能好，能源利用率高，能同时实现废水硝化和生物产电。