本发明公开了一种利用煅烧黄铁矿处理地下水中硝态氮的方法，其特征是：以煅烧黄铁矿颗粒物与石灰岩颗粒物作为下层滤料装填滤柱，在下层滤料表面附着脱氮硫杆菌和依赖硝酸盐铁氧化菌后，再在下层滤料上方填充褐铁矿颗粒物作为上层滤料；取地下水，按照自下而上的方向注入滤柱内，控制水力停留时间为4-24小时，使地下水中的所含硝酸盐与过滤介质发生化学和生物化学反应，转化为氮气而去除。本发明的方法处理效率高、成本低。