本发明提供一种工业废水深度处理过滤系统，包括预处理装置、无机膜错流过滤器和浓缩废物过滤装置；所述无机膜错流过滤器包括壳体、上花板、下花板、原液仓、渗透仓、浓缩液仓，以及位于渗透仓内的若干管式无机膜。本发明提供上述过滤系统对工业废水的过滤方法。本发明使用无机膜错流过滤器来实现固液分离，简化现有工艺，可一次性得到达标排放水；无机膜错流过滤器采用错流过滤技术，其进料方向平行于管式无机膜的膜面，对膜面具有很好的冲刷作用，可有效减少滤饼沉积，显著提高膜通量，减少膜的清洗周期；且无机膜错流过滤器密封性好，组装方便，通量大，膜丝不易断裂，能够避免油性液滴堵塞过滤膜孔，实现长寿命高效率的过滤方式。