本发明公开了一种城乡污染水体污染源生态拦截技术，以解决开放性的污染水体外源污染的拦截问题及污染水体的生态修复问题，通过在（1）在河道污染源入口段沿河道长度方向设置两道污染源生态拦截墙形成拦截区；（2）在拦截区内的河道两侧，设置生态浮岛；（3）向拦截区内投放复合酶和复合微生物来净化水体；（4）向拦截区内投放水生动物来净化水体。从而提升水质，改善水体生态环境，同时达到优化景观的效果。