本发明公开了一种秸秆厌氧好氧一体化发酵方法，按照每立方米沼气池本体的体积对应秸秆55kg的重量比例称取秸秆，粉碎后，混入占秸秆重量0.2％的碳酸氢铵，然后将秸秆通过进料口加入到好氧发酵池中，开启沼液回流装置，将沼液通过喷头洒到好氧发酵池内的秸秆上，控制秸秆与沼液的重量比为1∶1，发酵过程中进料口开启，进行好氧发酵，发酵时间为7天；发酵后，通过插槽开启开口，将秸秆投入沼气池本体中，由于沼气池本体中有一层网板，因此秸秆会在网板上方进行厌氧发酵。本发明技术设计合理，沼气池结构简单，操作方便，省时省力，能够持续供气，成本低廉，适应性强，便于推广使用。