本发明公开了利用组织培养法生产苹果类黄酮。本发明提供了一种利用组织培养法制备类黄酮的方法，包括如下步骤：1)将R6R6基因型植株外植体在愈伤组织诱导培养基中诱导培养，得到愈伤组织；2)将所述愈伤组织在继代培养基中继代培养，得到继代愈伤组织；3)将所述继代愈伤组织在增强培养基中增强培养，得到增强后愈伤组织；4)提取所述增强后愈伤组织中的类黄酮，得到目的产物。本发明的实验证明，利用上述方法培养的愈伤组织，其类黄酮含量是‘金帅’等苹果品种果肉类黄酮含量的30倍以上，可以实现利用组织培养法进行苹果类黄酮的工业化生产。