本发明公开了一种腐植酸降解菌株，该菌株分离自某自来水厂生物活性炭滤池。为一株食酸菌（Acidovorax sp.），菌株保藏号为：CGMCC No.6564，2012年9月20日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏。所述的一种腐殖酸降解菌株，其特征是将其应用于含腐植酸的微污染水的处理中。处理方法为：挑取此菌落，扩大培养后制成菌悬液，调节OD₆₀₀为0.6，按体积比为1%的比例接种于腐植酸微污染水中，其对腐植酸初始浓度为15mg/L的微污染水COD的去除率为33.8%，UV₂₅₄的去除率为48.1%。研究腐植酸初始浓度、pH、温度这三个因素对该菌降解性能的影响后发现腐植酸初始浓度为20mg/L，反应温度为35℃时，能更好地发挥其对腐植酸的降解性能；微污染水呈酸性有利于该菌生长，促进其对腐植酸的降解。