本发明提供一种赖氨酸发酵液废水浓缩液的处理方法，所述赖氨酸发酵液废水浓缩液中含有硫酸铵，且硫酸铵的浓度为35-40重量%，该处理方法使得处理后的赖氨酸发酵液废水浓缩液中有机质的含量低于或等于2重量%，透光率高于或等于88%。本发明还提供一种发酵生产赖氨酸的方法，该方法包括将赖氨酸发酵菌种接入赖氨酸发酵培养基中，在流加碳源和流加氮源的条件下，进行发酵培养，所述氮源含有上述方法处理后的赖氨酸发酵液废水浓缩液。本发明通过控制处理后的赖氨酸发酵液废水浓缩液的有机质含量和透光率，使得所述浓缩液能够直接作为发酵法生产赖氨酸的无机氮源，不但能够满足赖氨酸发酵需要，而且降低了赖氨酸生产成本。