本发明公开了一种海岛海水淡化系统和方法。所述海岛海水淡化系统包括电力供应控制系统、柴油机余热回收系统、低温多效蒸馏系统；所述电力供应控制系统包括风力发电机及其控制器、柴油发电机及其控制器、逆变器和总控制器；所述柴油机余热回收系统包括散热器、换热器和温控三通流量调节阀；低温多效蒸馏系统包括低温多效蒸馏器和加热水箱。本发明海岛海水淡化系统和方法，与以风电为主、柴发为辅的海岛风/柴互补发电系统相配套，采用低温多效蒸馏设备及方法对海水进行淡化；风电充足时，将多余风电实现海水淡化；风电不足时通过柴油发电机余热实现海水淡化；对极其不稳定的风电有非常强的适应性，并保证在不同供电模式下都能实现海水淡化。