一种序批式全程自养脱氮颗粒污泥的高效运行方法属于高氨氮污废水处理与再生领域。在序批式反应器内，应用已经启动的CANON颗粒污泥的基础上研究溶解氧对反应器运行的影响，其步骤为：以CANON颗粒污泥为种泥，曝气提供反应所必需的溶解氧，在控制一定的溶解氧梯度的条件下，研究使反应器高效运行的方法。本发明解决了长期以来不能确定的溶解氧对CANON颗粒污泥运行效能的影响，验证了短时延时曝气对反应的较小影响，为CANON处理高氨氮废水的工程化应用提出了新思路。