本发明属于环境工程PCB行业中高络合铜、高氨氮废水处理技术领域，具体涉及一种碱性蚀刻废液处理后的高氨氮尾液零排放处理系统及方法。一种碱性蚀刻废液处理后的高氨氮尾液零排放处理系统，该处理系统是由物化破络除铜系统、管式微滤（TMF）澄清系统、倒极电渗析（EDR）浓缩系统、反渗透（RO）深度脱盐系统与蒸发结晶系统耦合而成。本发明将多项工艺进行协同与集成，形成广谱性强、可靠、易操作、经济有效处理工艺技术及装备，解决了高氨氮高络合铜废水不能稳定达标，以及深度处理提标与回用困难等技术难题，必将对我国PCB行业难达标排放或零排放废水处理发挥关键性作用。