本发明属于水处理和水资源保护的技术领域，具体涉及一种水处理用过滤杀菌沙石的制备及其应用方法，解决了水处理用化学杀菌剂的残留难题。制备方法步骤：载体的选用与制备，载体表面杀菌分子的选用与制备，载体表面预处理，载体表面杀菌分子的负载，表面洗脱。应用方法，每100Kg水加入1-3kg过滤杀菌沙石。本发明的显著特点是，沙石表面上的杀菌分子不易脱落，无残留。通过合理的级配，沙石既具有高效的杀菌作用，同时又具有净水功能，可重复使用，由此可替代传统的水处理用化学杀菌剂及使用方法。