本发明公开了一种复合生物滤净系统，包括箱体及设于箱体外侧的进水管和出水管，进水管上设有水压表，箱体分隔为五个独立的净化区，进水管通入第一净化区的上部，第一净化区的底部与第二净化区的底部连通，第二净化区的上部通过管道与第三净化区的底部连通，第四净化区置于第二净化区和第三净化区的上方，第四净化区的底部与第三净化区的上部连通，第四净化区的上部与第五净化区的底部连通，出水管接在所述第五净化区一侧的出水口；第二净化区和第三净化区的底部设有用于冲洗泥沙及沉淀颗粒物的排污口。结构简单，使用方便，滤净效果好，性价比高，环保自然。