本发明公开了一种柠檬酸中和废水的处理方法，该方法包括将柠檬酸中和废水与改性阴离子交换树脂进行接触，使柠檬酸中和废水中柠檬酸根离子吸附到所述树脂上，然后使用酸性洗脱剂进行洗脱，得到柠檬酸溶液；其中，所述改性阴离子交换树脂的功能基团含有Cl^-，以改性阴离子交换树脂的功能基团的总摩尔量为基准，所述改性阴离子交换树脂的功能基团Cl^-的含量为80摩尔％以上，所述柠檬酸中和废水的pH值为5-6。该方法能够将低浓度柠檬酸中和废水中的柠檬酸有效地回收，得到高纯度的柠檬酸溶液，通过该方法不仅能够降低柠檬酸的损失，能够提高柠檬酸收率，并且能够降低环保费用。