一种双室浮动床离子交换制脱盐水方法及装置，同时设置两套双室浮动床离子交换脱盐水装置，在每套装置的阳床进水管与阴床出水管之间设置连通管路，各自的连通管路上设有中间水箱和中间水泵；在两套装置之间的阳床进水管与阴床出水管之间交叉设置连通管路，并在所有连通管路上设有控制阀门，通过控制阀门的开闭，选择在两套装置中进行单套装置制水、两套装置串联制水、单套装置闭路循环或双套装置闭路循环的模式运行。本发明在新鲜水不进入阳床，不向脱盐水箱送水的情况下，保持装置不落床，维持装置的运行最佳条件，解决了脱盐水外排量大的问题，达到了减少外排水量，节约用水的目的。