本发明涉及一种利用小球藻净化碱性重金属废水的方法，属于小批量工业废水处理技术领域。收集Fe²⁺含量为10-80mg/L以及pH为10-13的废水，将其混合后，向其中添加种子液和小球藻，控制培养温度和光照条件，连续光照与连续黑暗交替进行培养至小球藻生长的对数期后，小球藻回收再利用，而废水则直接排放。将本发明净化方法应用于单次排放量小、但排放频率高、收集困难的碱性重金属废水的处理，具有处理方式灵活、操作方便等优点。