本发明涉及一种控制外来污染源及生态修复黑臭河道的净化方法。所述工艺采用生物膜净化装置预处理排污口废水、河道种植水生植物、放养水生动物、安装曝气增氧设备等相结合的工艺。与现有河道生态修复工艺相比，本发明的方法能够有效控制污染中小型河道排污口，适应河道河水水质及气候条件的大幅度波动，对水质变化适应性强、耐冲击负荷好，能有效削除河水的黑臭现象，对有机碳和氮、磷都有较好的去除效果，处理出水水质稳定、工程投资少、运行成本低，适用于处理各种污染的河道河水。