本发明属于污水处理技术领域，公开了一种聚磷颗粒污泥优势菌种的快速筛选方法。该方法包括以下步骤：（1）在序批式反应器中采用模拟城市污水驯化反硝化除磷菌，得到反硝化除磷活性污泥；（2）将步骤（1）中形成的反硝化除磷活性污泥在序批式反应器中快速形成反硝化除磷颗粒污泥；（3）将步骤（2）得到的反硝化除磷颗粒污泥进行内源饥饿反应，通过快速沉降法筛选优势菌种聚磷菌。本发明提出的方法能快速富集实验室SBR颗粒污泥技术样品中的聚磷菌，提高聚磷菌比例，控制和淘汰聚糖菌，使聚磷菌和聚糖菌之间的竞争能够得以控制，提高菌种筛选效率，为提高和稳定反硝化除磷效果提供了可靠的保证。