本发明公开了一种改性分子筛为催化剂处理含低浓度全氟辛酸铵废水的方法，改性分子筛的制备：配制含有硝酸铈、硝酸铅、硝酸锰或硝酸铁的混合溶液，将分子筛浸渍于混合溶液中，取出干燥、焙烧；臭氧催化氧化：将得到的改性分子筛和含全氟辛酸铵浓度为50～500mg/L、温度为20～100℃的废水倒入容器中，通入臭氧，同时开动搅拌30～120分钟；改性分子筛的回收：经过臭氧催化氧化得到混浊溶液，通过静置、离心或者过滤，将改性分子筛从溶液中分离出来，用于下一次的催化氧化过程。该方法的优点在于处理效率高、操作简便，无二次污染，运行成本低等。