本发明公开了一种利用水稻秸秆制取生物油作为藻类抑制剂的方法，步骤：第一步，采用粉碎后的水稻秸秆，取筛选后的水稻秸秆粉末，干燥；第二步，采用鼓泡流化床生物质快速热裂解装置，以干燥后的水稻秸秆粉末为原料制取生物油；第三步，根据所测的该种生物油对典型淡水藻的半效应浓度值，计算向水体中施用生物油的量。本发明利用水稻秸秆制取生物油作为藻类抑制剂的方法，原料为农业剩余物，来源广泛，使资源得到再利用，本发明制得生物油的过程中，无需再添加任何添加剂，也无需进行任何分离纯化，制取后即可使用。本发明步骤简单，制得的生物油具有快速生物降解性能，28天生物降解率为41～53%，具有生态安全性，不会造成二次污染。