本发明公开了一种石油天然气钻井作业废弃泥浆微生物处理工艺，涉及石油天然气勘探钻井污染治理技术领域，按照下述步骤实施处理工艺：a、准备一用于对废弃泥浆微生物进行处理的池子；b、在池子的底部铺设多根横管，横管上连接有竖管，横管上穿孔；c、在池子的底部铺设石子，石子的铺设厚度大于所述横管的管径；d、在石子的上方铺设一层无纺布；e、在无纺布的上方铺设沙子；f、在沙子上铺设已准备好的废弃泥浆混合物；g、在废弃泥浆混合物上覆盖自然土壤，并栽种植物。本发明降低了填埋池厌氧区域，能在较短时间完成降解过程，使混合物达到国家土壤三级标准，消除环境风险。