本发明公布了一种利用刮食性鱼类和周丛生物联合控制湖泊富营养化的方法，包括调查湖泊周丛生物生物量、设置人工基质、刮食性鱼类的选择和刮食性鱼类的捕捞等步骤。本发明利用周从生物对水体氮磷的高吸收率的特点，通过设置人工基质，加大水体中周丛生物的生物量，从而增加了其对水体中氮、磷的吸收和转化量，而刮食性鱼类的饵料恰好是各种基质上的周丛生物，通过增殖一定量的刮食性鱼类，利用其可以刮食各种基质上周丛生物的食性特点，提高水体的渔产力，同时也可降低水体中氮磷营养物质的浓度，不仅具有生态效应，同时具有一定的经济效益。从而实现生态效应和经济效益综合优化的效果。