本发明提供了一种河道污染底泥原位生态修复方法，是在河道的底泥上铺设上中下三层植生生态混凝土，下层为厚度5cm-10cm的不发泡植生生态混凝土，其作用是阻隔底泥污染物向上覆水水体的释放；混凝土中添加铁铝氧化物；中间层为10cm厚的发泡植生生态混凝土，其作用是为沉水植物生长提供载体，发泡混凝土层中分布有活性炭颗粒堆，在活性炭颗粒堆中种植沉水植物；上层为2cm-5cm厚的发泡植生生态混凝土，该层混凝土中添加铁铝氧化物。本发明简单易行，操作方便，利用植生生态混凝土砖覆盖河道底泥，阻止了底泥中的重金属进入水体，切断了污染源的污染途径，不易产生二次污染，并通过沉水植物吸收底泥中的重金属。