一种磁活性污泥反应装置及其实现短程脱氮的方法，属于污水处理领域。反应器安装进水管、出水管和排泥管、便于污水和磁活性污泥充分混合的搅拌装置、底部设置微孔曝气圆盘，微孔曝气圆盘和鼓风机之间设有气体流量计；在反应器内壁上安装溶解氧DO，氧化还原电位ORP和pH电极，外部安装有显示控制器、PID控制器、计算机。实现短程硝化的方法:在MLSS=13000mg/L下，基于pH值曝气控制策略；在线控制自动运行。本发明适用于城市污水处理厂及其它诸如养殖废水、味精废水、焦化废水等含氮有机工业废水的处理，以节能降耗为目的，具有操作管理简易、节省人力物力、较高的反硝化速率、较小的反应容积和较低的污泥产量、并能有效的减少污泥处理与处置费用等优点。